M. thoracata được phân biệt với M. picta qua vây lưng ngắn; vây hậu môn có 6 vây tia thay vì 4 hoặc 5; có một dải chấm hoặc màu sẫm ở gốc các vây tia của vây đuôi so với vây đuôi có dải màu sẫm nằm ngang[2]. Megalechis phát triển đến độ dài khoảng 12 – 15 cm[2]. Megalechis có thể thở trên cạn khi di chuyển để tránh hạn hán và quay trở lại suối khi mùa mưa đến[5].

Cá đực trưởng thành có một ngạnh vây ngực rất phát triển, như của Hoplosternum littorale[4]. Cá đực M. thoracata thường lớn hơn so với cá mái[6].